万方查重工具是目前广泛应用于硕士论文适用性分析中的工具之一。其方法主要包括：1.文本比对分析，通过对论文文本与数据库中已有文献进行比对，检测论文原创性和重复率；2.数据统计分析，利用工具提供的数据统计功能，对论文中的数据进行分析和比对；3.图表展示分析，通过工具生成的图表展示论文数据，方便进行适用性分析。这些方法结合使用，可以全面评估硕士论文的适用性，帮助学者提升论文质量。

除了万方查重工具外，还可以采用其他方法进行硕士论文适用性分析，如：1.文献综述分析，通过对相关文献进行综述分析，评估论文的学术价值和创新性；2.专家评审分析，邀请领域内专家对论文进行评审，提出改进建议；3.实证研究分析，采用实证研究方法对论文提出的假设进行验证。综合运用这些方法，可以全面深入地评估硕士论文的适用性，为学术研究提供有力支持。